新皇崗聯檢大樓的工程現正全速推進，外媒已經走進現場，看到大量工人正忙於收尾作業。這座預計日客流可達20萬人的新口岸，採用「合作查驗、一次放行」的通關模式，使旅客過關時間從原先的約30分鐘，縮短至5分鐘；展望未來，還可能導入以人臉識別與虹膜識別為核心的智慧過關技術。
依據深圳衛視的報導，聯檢大樓內部天花板裝點着巨大的簕杜鵑花裝飾，層層綻放的花瓣讓日光透過花瓣縫隙灑落，整座大樓的規模與內部設計，宛如機場出入境大堂般宏偉。
深圳市口岸辦規劃建設處的一級主任科員田耕指出，此棟聯檢大樓分為地下四層與地上五層。地下四層匯聚五條軌道線路以實現換乘；大樓一層負責查驗入境車輛，三層負責查驗出境車輛，四、五層則為旅客的出入境大廳。